Ο Δρ. Αναγιωτός είναι Πρύτανης του Τεχνολογικού Πανεπιστημίου Κύπρου (ΤΕΠΑΚ) από το 2016. Κατά τη διάρκεια της πρυτανικής του θητείας, το Πανεπιστήμιο κατατάχθηκε μεταξύ των 351–400 καλύτερων πανεπιστημίων στον κόσμο σύμφωνα με την κατάταξη Times Higher Education World University Rankings.

Έχει διαδραματίσει καθοριστικό ρόλο στη διεθνοποίηση του Πανεπιστημίου και στην ίδρυση του INTENT, του Γραφείου Καινοτομίας και Μεταφοράς Τεχνολογίας του Πανεπιστημίου, με στόχο την προώθηση της καινοτομίας και την αξιοποίηση των ερευνητικών αποτελεσμάτων του ΤΕΠΑΚ. Επίσης, συνέβαλε καθοριστικά στην ίδρυση του CUTing Edge για την προώθηση της καινοτομίας και της επιχειρηματικότητας στο Πανεπιστήμιο.

Διετέλεσε Αντιπρύτανης του Πανεπιστημίου κατά την περίοδο 2012–2015, καθώς και μέλος του Διοικητικού Συμβουλίου του Ανοικτού Πανεπιστημίου Κύπρου το 2011.

Είναι Διευθυντής του Εργαστηρίου Βιομηχανικής και Ανάλυσης Ζώντων Συστημάτων (BioLISYS) στο Τεχνολογικό Πανεπιστήμιο Κύπρου (http://www.cut.ac.cy/biolisys/). Υπήρξε επίσης Διευθυντής του Εργαστηρίου Βιορευστών (Biofluids Laboratory) στο Τμήμα Βιοϊατρικής Μηχανικής του Πανεπιστημίου της Αλαμπάμα στο Μπέρμιγχαμ.

Το εργαστήριο BioLISYS ασχολείται με έρευνα στους ακόλουθους τομείς:
α) Νέες τεχνικές απεικόνισης στον καρκίνο και στις καρδιαγγειακές παθήσεις,
β) Καρδιαγγειακή δυναμική ρευστών βασισμένη σε απεικονιστικά δεδομένα,
γ) Σχεδιασμός, δοκιμή και αξιολόγηση καρδιαγγειακών εμφυτευμάτων.

Ο Δρ. Αναγιωτός έχει δημοσιεύσει περισσότερες από 150 επιστημονικές εργασίες σε περιοδικά με σύστημα κριτών (peer-reviewed) καθώς και δημοσιεύσεις σε πρακτικά συνεδρίων. Έχει αναπτύξει πολυάριθμα μαθήματα στους τομείς της Βιοϊατρικής και της Μηχανολογικής Μηχανικής.

Έχει διατελέσει διοργανωτής και πρόεδρος πολυάριθμων τεχνικών συνεδριών και συζητήσεων πάνελ στην Biomedical Engineering Society, στο World Congress of Biomechanics και στο Summer Bioengineering Conference.

Είναι Αναπληρωτής Συντάκτης (Associate Editor) στα επιστημονικά περιοδικά Annals of Biomedical Engineering και Ultrasound in Medicine and Biology και κριτής (reviewer) σε πολυάριθμα άλλα διεθνή επιστημονικά περιοδικά.

Ο Δρ. Αναγιωτός είναι εμπειρογνώμονας αξιολογητής στον τομέα της Βιομηχανικής για την Ευρωπαϊκή Ένωση, τα National Institutes of Health (ΗΠΑ) και το National Science Foundation (ΗΠΑ) από το 1999.

Έχει επίσης προσφέρει συμβουλευτικές υπηρεσίες σε πολυάριθμους κατασκευαστές καρδιαγγειακών εμφυτευμάτων και ιατροτεχνολογικών συσκευών, όπως οι: Boston Scientific Corporation, Cardiac Dimensions (Kirkland, WA), Advanced Catheter Engineering (Livermore, CA), Arrow International (Reading, PA), Converge Medical Technologies (Pleasanton, CA), Embolic Protection Technologies (Boston Scientific Co., St. Paul, MN), Mindguard LTD (Ισραήλ), Advanced Stent Technologies (Pleasanton, CA), Guidant Corporation (St. Paul, MN), Codman & Shurtleff (J&J, Boston, MA), Gambro Healthcare Co. (Lakewood, CO) και Huie, Fernambucq & Stewart LLP (Birmingham, AL).

Οι απόφοιτοι του εργαστηρίου του εργάζονται σήμερα στο NASA Glenn Research Center (ΗΠΑ), στο Emory University (ΗΠΑ), στο University of Dundee, στην Boston Scientific Corporation, στη Johnson & Johnson και σε πολλούς άλλους κατασκευαστές καρδιαγγειακών εμφυτευμάτων.

Έχει επίσης διοριστεί ως μέλος της επιτροπής της ESA από την Κυβέρνηση της Κυπριακής Δημοκρατίας.