Στόχος του μαθήματος είναι η εξοικείωση των φοιτητών με: (1) τους ταξινομικούς χαρακτήρες των φυτών,  (2) τα συστήματα ταξινόμησης και την επιστημονική ονομασία των φυτών καθώς και (3) με τα βασικά μορφολογικά χαρακτηριστηκά και τη συστηματική κατάταξη των κυριότερων οικογενειών των φυτών που απαντούνται στη Κυπριακή χλωρίδα, και φυτών οικονομικής σημασίας.

Το μάθημα πραγματεύεται τη συστηματική ταξινόμηση, οικολογία και προσδιορισμό των φυτών, με έμφαση στη χλωρίδα της Κύπρου και στα φυτά οικονομικής σημασίας. Βασικός σκοπός του μαθήματος της Συστηματικής Βοτανικής είναι έκμαθηση των ταξινομικών χαρακτήρων των φυτών καθώς και των βασικών αρχών ταξινόμησης και επιστημονικής ονομασίας.

Οι φοιτητές αναμένεται να διατυπώνουν τους εισαγωγικούς ορισμούς περί Συστηματικής Βοτανικής και να εξηγούν πως καθιερώθηκαν τα συστήματα ταξινόμησης των φυτών και που βασίστηκαν. Οι φοιτητές θα πρέπει να μπορούν να αναφέρουν τις ταξινομικές μονάδες με σειρά από τη μικρότερη (είδος), μέχρι τη μεγαλύτερη.  

Ο φοιτητής αναμένεται να κατανοούν την χρησιμότητα των  κλείδων ταξινομικού προσδιορισμού και να εξοικειωθεί στη χρήση της διχοτομικής κλείδας η οποία αποτελεί το πιο απλό σύστημα για την εύκολη και γρήγορη ταξινόμηση των φυτών στις βασικές ταξινομικές μονάδες. Ταυτόχρονα θα κατανοούν την λειτουργικότητα των κλείδων ταξινομικού προσδιορισμού και το τρόπο αξιοποίησης τους στην αναγνώριση της ταυτότητας άγνωστων φυτικών υλικών.

Με την επιτυχή ολοκλήρωση του μαθήματος ο φοιτητής/τρια θα είναι σε θέση να εντοπίζει τα βασικά μορφολογικά χαρακτηριστικά και να κατατάσσει με συστηματική ταξινόμηση τις κυριότερες οικογένειες των φυτών που απαντούνται στη Κυπριακή χλωρίδα και των φυτών οικονομικής σημασίας.