Στόχος του μαθήματος είναι η κατανόηση εννοιών στη μικροβιολογία των τροφίμων εστιάζοντας κυρίως στις αρνητικές επιπτώσεις τους στα τρόφιμα καθώς και στους τρόπους πρόληψης και αντιμετώπισης τους με τις κατάλληλες πρακτικές υγιεινής. Επί μέρους θέματα που διδάσκονται είναι: Κατηγορίες και ταξινόμηση των μικροοργανισμών που ενδιαφέρουν τα τρόφιμα. Ενδογενείς και εξωγενείς παράγοντες που επηρεάζουν το ρυθμό ανάπτυξης/ επιβίωσης των μικροοργανισμών (νερό, pH, προσθήκη συντηρητικών,  θερμότητα, συσκευασία υπό συνθήκες τροποποιημένης ατμόσφαιρας) και τα κύρια παθογόνα που μεταδίδονται μέσα από τα τρόφιμα.  Κλασικές τεχνικές μέτρησης/ προσδιορισμού των μικροοργανισμών. Έλεγχος της μόλυνσης.

Οι  φοιτητές θα κατανοήσουν τη θεμελιώδη σημασία των μικροοργανισμών για τα τρόφιμα (κυρίως όσον αφορά τις αρνητικές τους επιδράσεις: αλλοιώσεις και πρόκληση τροφιμογενών νοσημάτων).

Επίσης, οι φοιτητές θα είναι σε θέση να περιγράψουν τους δείκτες (οργανοληπτικούς, μικροβιολογικούς και χημικούς) της μικροβιακής αλλοίωσης των τροφίμων και τους κύριους μικροοργανισμούς που συνδέονται με την αλλοίωση των διαφόρων κατηγοριών τροφίμων.

Θα κατανοήσουν  τη σημασία των τροφιμογενών νοσημάτων στη δημόσια υγεία και την οικονομία μιας χώρας και θα μπορούν να προσδιορίσουν τους τύπους των μικροβιακών τροφιμογενών νοσημάτων (τροφοτοξινώσεις, τροφικές λοιμώξεις και τοξικολοιμώξεις) και τους παθογόνους μικροοργανισμούς που σχετίζονται με τον κάθε τύπο.

Επίσης, οι φοιτητές θα πρέπει να μπορούν να επικοινωνούν αποτελεσματικά σε μια ομάδα και να οργανώνουν το χρόνο τους εντός της ομάδας κατά την εκτέλεση των εργαστηριακών ασκήσεων ώστε να ετοιμάσουν και να δώσουν μια αποτελεσματική αναφορά για κάθε εργαστηριακή άσκηση. Τέλος οι φοιτητές θα μπορούν να χρησιμοποιούν βασικές εργαστηριακές τεχνικές Ασηπτικών Τεχνικών και Μικροβιολογίας καθώς και όλες τις αρχές καλών εργαστηριακών πρακτικών